作者：Daniel Borcard Fran
页数：456
出版社：高等教育出版社
出版日期：2018
ISBN：9787040539509
电子书格式：pdf/epub/txt
内容简介
近年来，随着新的数据分析方法在生态学和环境科学研究中的迅速发展和大数据时代的来临，R语言统计软件以其灵活、开放、易于掌握、免费等诸多优点，在生态科学和环境科学研究领域迅速传播并赢得广大研究者的青睐。数量生态学方法是现代生态学研究的重要工具，本书是连接数量生态学方法和R语言的桥梁。本书首先介绍探索性数据分析和关联矩阵的构建，然后介绍数量生态学的三类主要方法：聚类分析、排序（非约束排序和典范排序）和空间分析。本书的重点不是介绍数量方法的理论基础和数学公式，而是在简要介绍分析方法原理的基础上，利用案例数据，手把手地教大家如何在R中实现数量分析。本书可作为生态学、环境科学及其他相关领域（例如海洋学、分子生态学、农学和土壤科学）专业本科生和研究生的教学参考书，也可作为相关专业科研人员的自学参考书。
本书特色
近年来，随着新的数据分析方法在生态学和环境科学研究中的迅速发展和大数据时代的来临，R语言统计软件以其灵活、开放、易于掌握、免费等诸多优点，在生态科学和环境科学研究领域迅速传播并赢得广大研究者的青睐。数量生态学方法是现代生态学研究的重要工具，本书是连接数量生态学方法和R语言的桥梁。本书首先介绍探索性数据分析和关联矩阵的构建，然后介绍数量生态学的三类主要方法：聚类分析、排序（非约束排序和典范排序）和空间分析。本书的重点不是介绍数量方法的理论基础和数学公式，而是在简要介绍分析方法原理的基础上，利用案例数据，手把手地教大家如何在R中实现数量分析。本书可作为生态学、环境科学及其他相关领域（例如海洋学、分子生态学、农学和土壤科学）专业本科生和研究生的教学参考书，也可作为相关专业科研人员的自学参考书。
目录
1.1 为什么需要数量生态学？
1.2 为什么用R？
1.3 本书的读者群和结构
1.4 如何使用本书
1.5 数据集
1.5.1 Doubs鱼类数据集
1.5.2 甲螨数据集
1.6 关于R帮助资源的提醒
1.7 现在是时候了
第2章 探索性数据分析
2.1 目标
2.2 数据探索
2.2.1 数据提取
2.2.2 物种数据：第一次接触
2.2.3 物种数据：进一步分析
2.2.4 生态数据转化
2.2.5 环境数据
2.3 小结
第3章 关联测度与矩阵
3.1 目标
3.2 关联测度的主要类别（简短概述）
3.2.1 Q模式和R模式
3.2.2 Q模式下对称或非对称的系数：双零问题
3.2.3 定性或定量数据的关联测度
3.2.4 概括
3.3 Q模式：计算对象之间的相异矩阵
3.3.1 Q模式：定量的物种数据
3.3.2 Q模式：二元（有-无）物种数据
3.3.3 Q模式：定量数据（除物种多度数据外的数据）
3.3.4 Q模式：二元数据（除物种有-无数据外的数据）
3.3.5 Q模式：混合类型、包括分类（定性多级）变量
3.4 R模式：计算变量之间的依赖矩阵
3.4.1 R模式：物种多度数据
3.4.2 R模式：物种有一无数据
3.4.3 R模式：定量和序数数据（除物种多度外的数据）
3.4.4 R模式：二元数据（除物种多度外的数据）
3.5 物种数据的预转化
3.6 小结
第4章 聚类分析
4.1 目标
4.2 聚类概述
4.3 基于连接的层次聚类
4.3.1 单连接聚合聚类
4.3.2 第一连接聚合聚类
4.4 平均聚合聚类
4.5 Ward最小方差聚类
4.6 灵活聚类
4.7 解读和比较层次聚类结果
4.7.1 引言
