作者：梅步俊著
页数：151页
出版社：中国农业科学技术出版社
出版日期：2019
ISBN：9787511644305
电子书格式：pdf/epub/txt
内容简介
本书从单个片段sanger法测序到百千万个reads的高通量测序技术, 分子生物学的检测通量正在从单点分析过渡到大规模全面检测和分析。内容包括: 数量遗传学基础 ; 统计基因组学中的作图函数和重组率等。
作者简介
梅步俊(1978-)，男，汉族，出生于内蒙古自治区呼和浩特市，副教授；现任河套学院农学系动物科学教研室副主任(正科)；2006年9月~2009年7月就读于内蒙古农业大学动物科技学院，所学专业为动物遗传育种与繁殖，获农学博士学位；2009年10月~2012年8月于中国农业大学动物科技学院做博士后研究，从事畜禽统计基因组学研究；2015年6月~2016年7月在美国爱荷华州立大学动物科学系做访问学者；在国内外期刊发表论文20余篇，获得10项计算机软件著作权，出版著作一部。
本书特色
分子生物学发展到今天已有几十年的时间，从单个基因 real－time PCR检测到几万个基因同时检测的芯片技术；从单个片段 sanger法测序到百千万个 reads的高通量测序技术，分子生物学的检测通量正在从单点分析过渡到大规模全面检测和分析。不仅仅在分子生物学领域，近十几年互联网和计算机技术的高速发展使得在生物学日常生产和科研活动中产生的数据量也呈现极大增长。然而目前现状是具备专业知识的广大生物学工作者虽然能够利用 Excel、SPSS等软件进行一般的数据分析，但对于较大规模的数据和专业格式文件等往往束手无策。本书共分五章，从Linux系统基本操作、统计遗传学基础原理到高通量数据分析。目的是让非计算机专业的生物学工作人员能够较快地学会信息分析和数据处理的方法与技巧，并可以自己动手完成相关数据工作。
目录
绪论 概率与数理统计简介 一、随机现象和随机试验 二、样本空间与事件 三、古典概型 四、条件概率和事件的独立性第一章 数量遗传学基础 第一节 基因频率和基因型频率 第二节 遗传效应和遗传差异 第三节 平均等位基因替代效应 第四节 遗传方差组分 第五节 遗传力 第六节 哈代-温伯格平衡条件下的F2家系 第七节 模拟基因型分布 第八节 哈代一温伯格比例检测第二章 统计基因组学中的作图函数和重组率 第一节 Mapping函数与重组 一、物理图谱和遗传图谱 二、作图函数的推导 三、Haldane作图函数 四、Kosambi作图函数 第二节 重组率 一、交配设计 二、重组率的最大似然估计 三、标准误差和显著性检验 四、估计r期望极大化算法(EM) 五、多点方法计算缺失基因型的概率 第三节 作图函数的导出 一、推导第一的积分知识 二、Haldane作图函数 三、Kosambi作图函数 四、Haldane作图函数的另一种推导方式第三章 R语言入门 第一节 R语言简介 一、R语言的特点 二、R语言的缺点 三、重要概念：CRAN 第二节 应用举例 第三节 R语言的数据操作 一、R语言与工作目录 二、改变工作目录 三、函数与对象 第四节 R语言统计学基础 一、t检验 二、方差分析 第五节 导人CSV、TXT文件 一、read.table函数 二、scan函数 三、readxl包 四、RODBC包(只适用于Windows) 五、XLConnect包 第六节 R语言中生成虚拟变量／哑变量 练习第四章 R语言绘图第五章 R语言应用于生物统计 一、方差检验 二、多水平多重复数据如何读取 三、相关性分析 四、回归分析 五、多元线性回归分析 六、变量选择与最优回归 七、Logistic回归 练习
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Article Title:《R语言在基因组分析中的应用》
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