生物信息学学习指导及习题集-第2版

第一章 生物序列资源学习目标知识要点一、引言二、NCBI数据库与数据资源三、LICSC基因组浏览器与数据资源四、EMBL-EBI数据库与数据资源五、重要的非编码基因数据库复习思考题一、名词解释二、问答题答案与题解第二章 序列比对学习目标知识要点一、引言二、比对算法概要三、数据库搜索四、比对软件、参数与数据资源五、比对技术的发展复习思考题一、选择题二、名词解释三、问答题四、上机实践答案与题解第三章 序列特征分析学习目标知识要点一、引言二、DNA序列特征分析三、蛋白质序列特征分析四、RNA序列与结构特征分析五、表达序列特征分析复习思考题一、选择题二、名词解释三、问答题四、上机实践答案与题解第四章 分子进化分析学习目标知识要点一、引言二、系统发生树分析与重建三、核苷酸和蛋白质的适应性进化四、分子进化与生物信息学复习思考题一、选择题二、问答题三、计算题答案与题解第五章 基因芯片数据分析学习目标知识要点一、引言二、基因表达的测定平台、数据库三、数据的预处理、差异表达分析四、基因芯片数据的聚类或分类分析五、基因表达分析的常用软件复习思考题一、选择题二、问答题三、上机实践答案与题解第六章 蛋白质组与蛋白质结构分析学习目标知识要点一、引言二、蛋白质组数据的获取与分析三、蛋白质结构的预测四、蛋白质结构数据库五、蛋白质功能分析六、蛋白质结构异常与疾病复习思考题一、选择题二、名词解释三、问答题四、上机实践答案与题解第七章 基因注释与功能分类学习目标知识要点一、引言二、基因注释数据库三、基因集功能富集分析四、基因功能预测复习思考题一、选择题二、问答题三、上机实践答案与题解第八章 转录调控的信息学分析学习目标知识要点一、引言二、转录因子结合位点的信息学预测方法三、转录调控相关数据库复习思考题一、选择题二、名词解释三、问答题四、上机实践答案与题解第九章 生物分子网络和通路学习目标知识要点一、生物分子网络概述二、生物分子网络分析三、生物分子网络重构复习思考题一、选择题二、名词解释三、问答题四、上机实践答案与题解第十章 计算表观遗传学学习要点内容要点一、引言二、基因组的DNA甲基化三、组蛋白修饰的表观基因组四、基因组印记五、表观遗传学数据库和软件复习思考题一、选择题二、名词解释三、问答题答案与题解第十一章 复杂疾病的分子特征与计算分析学习目标知识要点一、引言二、复杂疾病的分子特征与数据资源三、复杂疾病的遗传易感与遗传定位分析四、常用的集成软件工具复习思考题一、选择题二、名词解释三、问答题四、上机实践答案与题解第十二章 非编码RNA与复杂疾病学习目标知识要点一、miRNA的特点及作用机制二、miRNA靶基因预测三、IncRNA及作用机制四、ncRNA主要数据资源五、ncRNA多态性分析六、利用ncRNA表达谱研究复杂疾病七、复杂疾病非编码RNA的计算识别复习思考题一、选择题二、问答题三、上机实践答案与题解第十三章 新一代测序技术与复杂疾病研究学习目标知识要点一、引言二、新一代测序技术概述三、DNA测序技术及应用四、RNA测序技术与数据分析五、ChIP-seq技术原理及分析方法六、新一代测序技术在其他领域应用复习思考题一、选择题二、名词解释三、问答题四、上机实践答案与题解第十四章 药物生物信息学学习目标知识要点一、引言二、药物靶标的信息学识别三、药物基因组学及其临床研究策略四、药物基因组相关生物信息资源五、基于药物基因组的个体化药物治疗复习思考题一、名词解释二、选择题三、问答题四、上机实践答案与题解