作者：常会会
页数：101
出版社：东北林业大学出版社
ISBN：9787567433991
电子书格式：pdf/epub/txt
内容简介
本书对线粒体基因组数据的获取、基因组的组装和注释方法进行了概述，并对基于一代测序和高通量测序测定46个直翅目物种的线粒体基因组的研究工作进行总结，以蝗总科的异歧蔗蝗、无齿稻蝗的线粒体基因组序列为例，对直翅目物种线粒体基因组的结构、碱基组成、氨基酸的使用、密码子使用频率、RNA二级结构、控制区特征等方面进行简单介绍。然后从比较基因组学角度对直翅目142个物种的mtDNA序列的大小、基因重排、碱基组成、密码子使用、氨基酸组成等方面进行比较分析。再从谱系基因组学角度利用直翅目171个物种的mtDNA数据进行了异质性、替换饱和等方面的分析，并通过数据划分选择模型构建系统发生树，对直翅目物种系统发生进行探讨。直翅目线粒体基因组数据的增加，将会为研究线粒体基因组进化特征和构建更加稳健的系统发生关系提供新数据，为构建更加稳健的直翅目系统发生关系和研究mtDNA进化特征提供新支撑。
目录
第1章绪论
1.1线粒体及线粒体基因组简介
1.2线粒体基因组研究策略及方法
1.3比较基因组学
1.4谱系基因组学
1.5直翅目系统发生中存在的问题
第2章线粒体基因组组装与注释
2.DNA的提取及质量检测
2.2基于PCR扩增和一代测序的mtDNA测定方法
2.3基于高通量测序的mtDNA测定方法
2.4线粒体基因组的注释
2.5线粒体基因组组成分析
第3章直翅目线粒体基因组测定和分析实例
3.1试验材料与方法
3.DNA提取、测序、组装及注释
3.3线粒体基因组组成与分析
第4章直翅目线粒体比较基因组学分析
4.1线粒体基因组大小
4.2线粒体基因组基因重排
4.3线粒体基因组的间隔区和重叠区
4.4线粒体基因组基因长度的变化
4.5线粒体基因组碱基组成
4.6线粒体基因组密码子组成
4.7线粒体基因组氨基酸组成
4.8线粒体基因组tRNA基因与rRNA基因
4.9线粒体基因组D-Loop区比较
第5章直翅目线粒体谱系基因组学分析
5.1数据来源
5.2数据集的构建与评估
5.化模型选择
5.4系统发生树的构建
5.5直翅目线粒体谱系基因组学分析结果与讨论
参考文献
1.1线粒体及线粒体基因组简介
1.2线粒体基因组研究策略及方法
1.3比较基因组学
1.4谱系基因组学
1.5直翅目系统发生中存在的问题
第2章线粒体基因组组装与注释
2.DNA的提取及质量检测
2.2基于PCR扩增和一代测序的mtDNA测定方法
2.3基于高通量测序的mtDNA测定方法
2.4线粒体基因组的注释
2.5线粒体基因组组成分析
第3章直翅目线粒体基因组测定和分析实例
3.1试验材料与方法
3.DNA提取、测序、组装及注释
3.3线粒体基因组组成与分析
第4章直翅目线粒体比较基因组学分析
4.1线粒体基因组大小
4.2线粒体基因组基因重排
4.3线粒体基因组的间隔区和重叠区
4.4线粒体基因组基因长度的变化
4.5线粒体基因组碱基组成
4.6线粒体基因组密码子组成
4.7线粒体基因组氨基酸组成
4.8线粒体基因组tRNA基因与rRNA基因
4.9线粒体基因组D-Loop区比较
第5章直翅目线粒体谱系基因组学分析
5.1数据来源
5.2数据集的构建与评估
5.化模型选择
5.4系统发生树的构建
5.5直翅目线粒体谱系基因组学分析结果与讨论
参考文献
