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泛素家族介导的蛋白质降解和细胞自噬

封面

作者:邱小波等

页数:732

出版社:科学出版社

出版日期:2020

ISBN:9787030603463

电子书格式:pdf/epub/txt

内容简介

机体内多数蛋白质在行使功能后或在合成过程中出现异常都需要被降解,产生的氨基酸还可再利用。细胞内大多数蛋白质的降解通常由泛素-蛋白酶体通路执行。而在特定的生理或病理条件下,细胞自噬可通过溶酶体降解错误折叠蛋白、蛋白质聚集物和细胞器等细胞内物质。本书将对该领域近期新进展、重要的研究方法及其应用进行全面介绍。相信本书的出版将有力地推动相关研究领域在我国的发展。

目录

目录

第一章 泛素家族概论 1

第一节 泛素家族概述 1

第二节 泛素家族异常与人类疾病 4

第三节 溶酶体-自噬通路及其在蛋白质降解中的作用 5

第四节 泛素研究的背景与前景 7

第五节 小结 11

参考文献 11

第一篇 泛素-蛋白酶体通路

第二章 泛素化概论 15

第一节 泛素化的生物化学基础 15

第二节 泛素密码 25

第三节 泛素化修饰及其生物学功能 32

第四节 蛋白质翻译后修饰之间的对话 36

参考文献 40

第三章 泛素和类泛素激活酶 42

第一节 概述 42

第二节 泛素激活酶的表达和纯化 44

第三节 人类拟泛素激活酶APPBP1/UBA3异二聚体复合物的表达和纯化 44

第四节 激活酶UBE1L的表达和纯化 48

参考文献 49

第四章 泛素耦合酶 51

第一节 概述 51

第二节 泛素耦合酶UBC4/5家族的表达和纯化 55

第三节 泛素耦合酶Cdc34、UBC13和MMS2的表达及纯化 59

第四节 检测泛素耦合酶-泛素硫酯中间产物形成的高通量方法 63

参考文献 66

第五章 泛素连接酶 68

第一节 概述 68

第二节 实验技术 79

参考文献 137

第六章 泛素结合蛋白 140

第一节 泛素结合蛋白的特性和种类 141

第二节 泛素结合蛋白的功能 144

第三节 泛素结合蛋白与人类疾病 146

第四节 泛素结合结构域分析方法 147

参考文献 164

第七章 去泛素化酶 166

第一节 去泛素化酶的分类 166

第二节 去泛素化酶的作用机制 168

第三节 去泛素化酶的生理和病理功能 171

参考文献 173

第八章 相素化修饰 175

第一节 相素化修饰的生物学作用 175

第二节 相素化修饰及相关酶 177

第三节 相素化修饰相关基因敲除模型 181

第四节 相素化修饰与人类疾病 183

第五节 蛋白质相素化修饰分析方法 185

第六节 相素耦合酶UBC9的表达、纯化和活性鉴定 187

第七节 荧光共振能量转移方法分析相素化修饰 190

第八节 小结 195

参考文献 195

第九章 拟素化修饰 198

第一节 概述 198

第二节 拟素化修饰的蛋白底物 199

第三节 拟素化修饰与肿瘤 200

第四节 UBC12介导的拟素修饰实验 206

第五节 COP9信号体(CSN)的纯化 207

第六节 展望 224

参考文献 224

第十章 植物蛋白质的泛素化修饰 228

第一节 概述 228

第二节 植物体外泛素化检测修饰研究方法 231

第三节 植物体内快速高效检测蛋白泛素化修饰研究方法 238

参考文献 251

第十一章 植物蛋白质的相素化修饰 253

第一节 概述 253

第二节 实验技术 255

参考文献 260

第十二章 泛素化蛋白的质谱法鉴定 262

第一节 概述 262

第二节 泛素化蛋白的富集 264

第三节 泛素化蛋白的分离 271

第四节 泛素化蛋白的验证与定量 274

第五节 实验技术 277

参考文献 288

第十三章 泛素化修饰与表观遗传调控 290

第一节 概述 290

第二节 组蛋白泛素化的研究技术 292

第三节 组蛋白去泛素化的研究技术 294

参考文献 300

第十四章 泛素化修饰调控细胞代谢 302

第一节 泛素化修饰与糖代谢 302

第二节 泛素化修饰与脂质代谢 316

第三节 泛素化修饰调控氨基酸代谢 328

第四节 泛素化调控核酸代谢 336

第五节 代谢相关的信号通路与泛素化修饰 342

第六节 小结与展望 354

参考文献 355

第十五章 泛素化修饰与细胞周期调控 357

第一节 概述 357

第二节 细胞周期的泛素化修饰调控 361

第三节 泛素化修饰异常与人类疾病 378

第四节 实验技术 383

参考文献 388

第十六章 泛素化调节细胞死亡 389

第一节 细胞凋亡概述 389

第二节 细胞凋亡的调控 391

第三节 程序性坏死 408

第四节 泛素化调控决定细胞命运走向 409

第五节 凋亡检测方法 411

参考文献 415

第十七章 泛素化修饰调控固有免疫信号通路 418

第一节 泛素化修饰在TLR信号通路中的功能 418

第二节 泛素化修饰在RLR信号通路中的功能 422

第三节 泛素化修饰在NLR信号通路中的功能 427

第四节 泛素化修饰在STING依赖的信号通路中的功能 430

第五节 展望 432

参考文献 432

第十八章 蛋白酶体的结构与功能 435

第一节 蛋白酶体的组成与结构 435

第二节 蛋白酶体的作用机制 440

参考文献 447

第十九章 蛋白酶体的活性测定与纯化 449

第一节 蛋白酶体的活性测定 449

第二节 蛋白酶体及其激活物的纯化与分析 482

参考文献 496

第二十章 泛素-蛋白酶体通路与药物研发 498

第一节 概述 498

第二节 靶向泛素-蛋白酶体系统的小分子抑制剂 500

第三节 PROTAC技术 518

第四节 靶向泛素系统的药物研发策略 527

第五节 针对蛋白酶体的药物研发 533

第六节 展望 543

参考文献 544

第二篇 细胞自噬

第二十一章 细胞自噬概论 549

第一节 概述 549

第二节 自噬研究的历史 551

第三节 自噬的分子机制 554

第四节 自噬在生理学与疾病中的作用 564

参考文献 570

第二十二章 自噬的选择性 577

第一节 概述 577

第二节 与Atg8/LC3结合的受体蛋白 578

第三节 与Atg5结合的受体蛋白 585

第四节 分子伴侣介导的自噬的选择性降解 586

第五节 小结与展望 588

参考文献 588

第二十三章 泛素及类泛素信号对自噬的调控 592

第一节 类泛素蛋白介导自噬小体的形成及底物识别 592

第二节 泛素介导自噬受体构象改变和自噬受体复合物形成 594

第三节 泛素介导自噬小体形成和受体对底物的识别 596

第四节 泛素调控底物转运和自噬性降解 597

参考文献 599

第二十四章 蛋白聚集体自噬 601

第一节 概述 601

第二节 聚集体的形成、转运、识别和调控 602

第三节 聚集体自噬障碍与疾病 607

第四节 展望 611

参考文献 611

第二十五章 线粒体和细胞器自噬 614

第一节 线粒体和其他细胞器自噬 614

第二节 细胞器自噬的实验技术 622

参考文献 632

第二十六章 自噬与肿瘤 635

第一节 自噬抑制肿瘤的发生发展 635

第二节 自噬促进肿瘤发生发展的作用 637

第三节 自噬在肿瘤治疗中的应用 640

参考文献 642

第二十七章 酵母自噬研究方法 644

第一节 GFP-Atg8剪切实验 644

第二节 Pho8Δ60碱性磷酸酶实验 647

第三节 Ape1的成熟 649

第四节 Ape1的动力学研究 650

第五节 活细胞观察GFP-Atg8的循环周期 653

第六节 在atg1ts菌株中Atg9的运输 655

参考文献 657

第二十八章 线虫的自噬过程及分子机制 659

第一节 概述 659

第二节 线虫中的细胞自噬 659

第三节 线虫中的自噬实验技术 666

参考文献 672

第二十九章 自噬在临床的应用 675

第一节 自噬相关的药物分类 675

第二节 自噬相关药物作用的信号通路 682

第三节 自噬相关药物在临床的应用前景 689

参考文献 695

附录一 主要专业名词英汉对照 699

附录二 编委简介 707

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